囊胚移植第二天小腹轻微刺痛可能是在着床，但也可能是情精过度紧张、卵巢过度刺激综合征等原因引起的。通常情况下，在胚胎移植的第二天，囊胚会继续游荡，同时不断孵化和分裂，寻找适合着床的子宫内膜区域，同时，为着床做准备。第三天，胚胎开始与子宫内膜发生初步接触，准备黏附。此时，子宫内膜也变得更加柔软和富有营养，以支持胚胎的着床。
囊胚移植第二天会不会着床
首先要说明的是：每位准妈妈的身体情况不同，胚胎质量也不同。而且准妈妈们，有的是移植第3天卵裂胚，也有的是移植培养到第5天的囊胚。所以胚胎着床的时间会有差异，但是大概都会经历这样的过程。
第1天
小胚胎被移植到子宫腔内，它会自由自在的漂浮着，到了一个温暖的大环境里，它需要吸取从自身储备的营养，还有母体腔中的液体中获取营养。
第2天
小胚胎在继续发育，继续分裂，也在继续游动。虽然麻麻的肚里黑乎乎的，但是小胚胎在努力的往，麻麻的子宫里游。
第3天
小胚胎会继续在子宫、输卵管内游动，在这期间经过了几次分裂，成为一簇细胞群。它还在不断的成长。
第4天
小胚胎还没有生根落户，它不断在子宫内漂游着，充分吸收着营养，让自己更强壮。进而继续分裂着，第三天的鲜胚会发育成囊胚。第五天的囊胚会继续分裂更多的细胞。
第5天
小胚胎似乎已经找好了，自己安家的位置。它会分泌一种蛋白质分解酶，溶解和它接触的子宫内膜，努力的想把自己种进去。
第6天
自己往“土壤里”钻进去，还是要费些功夫的。小胚胎一边吸收营养，一边继续成长。
第7-8天
小胚胎终于钻进子宫壁啦!这个位置合适又舒服。当胚胎接触到母体的血液循环，着床基本完成。大多数妈妈不会有太多的感觉，少数妈妈着床的时候会感觉，小腹有刺痛或者坠痛感，极少数人会有着床出血。
第9-11天
随着胎盘的发育，逐渐增多的HCG的释放，有的妈妈验孕棒基本能测出怀孕啦!小胚胎也在子宫里安心的成长。
第12天
形成凝固塞，封闭囊胚进入子宫内膜的区域，植入过程已经大功告成!
第13-14天
胚胎宝宝安稳地躺在，内膜中等待长大，此时可以去医院验血，确认自己是否妊娠。