自然周期方案取卵后移植时间需要根据患者所需移植的胚胎类型来决定，自然或者促排卵周期，是在排卵后第三天移植第三天的胚胎，第五天移植第五天或者第六天的囊胚，比如，1号确定排卵，那就是4号解冻移植第三天的胚胎，6号解冻移植第五天或者第六天的囊胚。
自然周期胚胎移植时间
自然周期即没有使用药物干预，可自行排卵的月经周期。该方案移植胚胎的时间主要取决于女性所选择的移植的胚胎类型是鲜胚还是囊胚，才能确定：
1、取卵后培养三天时间的受精卵就是鲜胚，此女性身体各方面条件达到的情况下，就可以进行移植，即自然周期方案在取卵后3天可进行胚胎移植，所谓的身体各方面条件其实就是子宫内膜厚度是否达到8-12mm之间、心理状态是否良好等等。
2、囊胚是在鲜胚基础上又多在体外培养了2-3天得到的胚胎，即在取卵后的5-6天，若是身体各方面条件达到移植标准的话，是可以进行囊胚移植的。
3、当然在取卵后第三天或者是第五、六天身体条件都达不到移植标准的话，就能够先将胚胎进行冷冻保存，以免胚胎不停地新陈代谢，而出现凋亡，对于这部分女性来说，移植时间可能在取卵后的一个月内、也有可能在取卵后几个月甚至几年之后再进行。